Есть такая мощная, простая и бесплатная программка VirtualDub - "ДУБ" по русски. Она может жать файл с минимальными потерями и тем же кодеком что и исходник, надо только "правильный" фильтр подобрать при склейке или резке файлов. Функции так и зовутся - "Быстрая перекомпрессия" и "Нормальная перекомпрессия". Есть еще "прямопотоковое копирование" - то есть редактирует(клеит, режет) без сжатия.