1. Проверить с другим шнурком.
2. Проверить на другом компе.
3. Прверить с другим HDD.
Очень часто проблема с нестартом\неопределением внешних 2.5" HDD связана с некачественным питанием. По дефолту питание портов на материнке берется с дежурного канала +5vsb. При неисправности этого канала не хватает мощности для работы механического HDD. Варианты:
1. Переключить питание портов с +5vsb на +5v (основной). Процедура описана в мануале к мамке.
2. Подставить (для проверки) другой, заведомо исправный (новый) БП.
При успешном решении проблемы - свой БП в ремонт или на замену. При не успешном - менять коробку, т. к. не исключено её повреждение, например из за статического электричества.
ЗЫ: Внешние 2.5" HDD очень не любят всевозможные переходники\удлинители, и часто некорректно работают даже на "мордовых" разъемах корпуса.
ЗЗЫ: Тип файловой системы не влияет на работоспособность железа. Например в видеорегистраторах, где используются стандартные HDD, применяется ФС Ext2, которая вообще никак не опознается виндой. Однако это не отменяет гарантии на собственно железо HDD.