Отчасти так и должно быть. Как только винда загрузилась, для процессора появляется куча работы: загрузка всех программ и служб, находящихся в автозапуске. Так что на какое то время процессор действительно может быть загружен на 100%. Однако если это время начинает исчисляться минутами после старта винды, то это уже плохо. В таком случае мой вам совет: поставьте диспетчер задач Windows в автозагрузку, чтобы сразу после старта мочь посмотреть, какой именно процесс (или процессы) жрет ресурсы вашего CPU.